K-OTC와 장외 거래 플랫폼을 통한 비상장 주식 투자가 활발해지면서, 비상장 주식 양도소득세 세금 문제로 당황하는 투자자들이 늘고 있습니다. 스타트업 주식으로 3억 원의 수익을 올렸는데, 막상 세금 신고 시기가 되어서야 복잡한 절차와 높은 세율에 놀라는 경우가 많죠.
이 글에서는 소득세법 제94조를 근거로 비상장 주식 양도소득세 신고 절차와 절세 전략을 정리했습니다.
2026년 1월 기준 최신 정보로, 반기별 신고 기한을 놓치지 않도록 도와드리겠습니다.
Table of Contents
비상장 주식 양도소득세, 왜 꼭 신고해야 할까?
상장주식과 달리 비상장 주식은 대주주·소액주주 구분 없이 모든 양도 거래에 대해 양도소득세 신고 의무가 있습니다. 소득세법 제94조에 따라 양도차익이 없더라도 반드시 신고해야 하며, 미신고 시 무신고 가산세 20%가 부과됩니다.
특히 K-OTC를 통한 거래라도 중소·중견기업이 아닌 경우 과세 대상입니다. 단, K-OTC에서 중소·중견기업 주식을 거래하는 소액주주는 비과세 혜택을 받을 수 있습니다.
비상장 주식 양도소득세율 총정리 (2026년 기준)
비상장 주식의 양도소득세 세율은 중소기업 여부와 보유 기간에 따라 다릅니다. 소득세법 제104조에 따른 세율 구조는 다음과 같습니다.
| 구분 | 중소기업 주식 | 일반기업 주식 |
|---|---|---|
| 기본세율 | 10% (지방소득세 1% 포함 시 11%) | 20% (지방소득세 2% 포함 시 22%) |
| 1년 미만 보유 | 30% (지방소득세 3% 포함 시 33%) | 30% (지방소득세 3% 포함 시 33%) |
| 대주주 (과세표준 3억 초과) | 22% | 25% (지방소득세 2.5% 포함 시 27.5%) |
중소기업 판단 기준
중소기업기본법 시행령 제3조에 따라 업종별 평균매출액과 자산총액 기준을 충족해야 합니다. 제조업 기준으로 평균매출액 1,500억 원 이하, 자산총액 5,000억 원 이하가 대표적입니다.
대주주 기준 (비상장주식)
비상장주식의 경우 지분율 기준 없이 시가총액 10억 원 이상 보유하면 대주주로 분류됩니다. 대주주가 되면 과세표준 3억 원 초과분에 대해 더 높은 세율이 적용됩니다.
절세 포인트: 중소기업 주식을 1년 이상 보유 후 소액으로 분할 매도하면 11%의 낮은 세율 적용이 가능합니다.
신고 기한: 반기별 예정신고가 핵심
비상장 주식 양도소득세는 양도일이 속한 반기 종료일부터 2개월 이내에 예정신고를 해야 합니다.
2026년 신고 기한
- 상반기 (1월~6월) 양도분: 2026년 8월 31일까지
- 하반기 (7월~12월) 양도분: 2027년 2월 28일까지
- 확정신고: 다음 해 5월 1일~5월 31일
예를 들어, 2026년 3월에 주식을 매도했다면 2026년 8월 31일까지 예정신고를 완료해야 합니다. 예정신고를 놓치면 무신고 가산세 20%와 납부불성실 가산세가 추가됩니다.
홈택스 신고 방법
- 홈택스 로그인 → 세금신고 → 양도소득세 → 예정신고
- 양도가액, 취득가액, 필요경비 입력
- 세액 자동 계산 후 납부
비상장 주식 양도소득세의 복잡한 세액 계산과 증빙 서류 정리가 부담된다면, 전문적인 세무 지식을 담은 재테크 서적을 참고하는 것도 좋은 방법입니다. 특히 비상장 주식처럼 전문성이 필요한 분야는 체계적인 가이드를 활용하면 실수를 크게 줄일 수 있습니다.
증권거래세도 함께 신고하세요
비상장 주식 양도 시 양도소득세 외에도 증권거래세를 별도로 신고해야 합니다. 많은 투자자가 비상장 주식 양도소득세만 신고하고 증권거래세를 누락하는 실수를 범합니다.
증권거래세 계산
- 세율: 양도가액의 0.35%
- 농어촌특별세: 증권거래세의 20% (양도가액의 0.08%)
- 실효세율: 약 0.43%
예시: 1억 원에 주식을 매도한 경우
- 증권거래세: 100,000,000 × 0.35% = 350,000원
- 농어촌특별세: 350,000 × 20% = 70,000원
- 합계: 420,000원
증권거래세는 양도차익 발생 여부와 관계없이 거래 자체에 부과됩니다. 신고 기한은 양도소득세와 동일하게 반기별로 신고합니다.
절세의 핵심: 필요경비와 취득가액 증빙
양도소득세는 ‘(양도가액 – 취득가액 – 필요경비 – 기본공제 250만 원) × 세율’로 계산됩니다. 따라서 취득가액과 필요경비를 최대한 인정받는 것이 절세의 핵심입니다.
반드시 준비해야 할 증빙 서류
- 계좌이체 내역서: 주식 매입 시 송금 증빙 (가장 중요)
- 주식양수도계약서: 거래 당사자, 수량, 가격 명시
- 주금납입증명서: 유상증자 참여 시
- 주주명부: 회사 등기부에 등재된 주주 정보
필요경비로 인정받을 수 있는 항목
- 양도 시 지출한 K-OTC 수수료
- 증권거래세 및 농어촌특별세
- 법무사 비용 (명의개서 대행 등)
- 주식양수도계약서 작성 비용
증빙이 어려울 때: 환산취득가액 활용
10년 전 구두 계약으로 주식을 받았거나 계약서를 분실한 경우, 소득세법 시행령 제163조에 따른 환산취득가액을 적용할 수 있습니다.
환산취득가액 = 양도가액 × (취득 당시 기준시가 / 양도 당시 기준시가)
단, 환산취득가액을 적용하면 실제 취득가액보다 불리할 수 있으므로, 가능한 한 실제 거래 증빙을 확보하는 것이 중요합니다.
실전 팁: 주식 매매 시 반드시 계좌이체로 진행하고, 거래 내역을 캡처해 클라우드에 백업하세요. 주식양수도계약서는 공증 없이도 유효하지만, 날짜와 서명은 정확히 기재해야 합니다.
중요한 계약서와 증빙 자료를 체계적으로 보관하려면 고속 스캐너를 활용하는 것도 좋습니다. 5년 이상 보관해야 하는 서류를 디지털화하면 세무조사 시에도 즉시 대응할 수 있습니다.
실수하기 쉬운 함정: 저가 양도 시 부당행위계산 부인
시가와 거래가액의 차이가 크면 부당행위계산 부인 규정이 적용됩니다. 소득세법 제101조에 따라 다음 조건 중 하나라도 해당하면 시가로 양도한 것으로 간주됩니다.
- 시가와 거래가액 차이가 3억 원 이상
- 시가와 거래가액 차이가 시가의 5% 이상
예시: 시가 10억 원인 주식을 5억 원에 양도한 경우
- 차액 5억 원 > 3억 원 → 부당행위계산 부인 적용
- 양도가액을 10억 원으로 계산하여 양도소득세 부과
특수관계인 간 거래는 더욱 엄격하게 적용되므로, 가족이나 임직원에게 주식을 양도할 때는 반드시 적정가액을 확인해야 합니다.
5월 확정신고 전 체크리스트
비상장 주식 양도소득세 신고는 복잡하지만, 체계적으로 준비하면 절세와 가산세 회피가 모두 가능합니다. 아래 체크리스트를 지금 바로 확인하세요.
필수 점검 사항
✅ 양도일 확인: 주식 대금을 받은 날 또는 명의개서일 중 빠른 날
✅ 중소기업 여부 확인: 평균매출액 및 자산총액 기준
✅ 대주주 요건 확인: 시가총액 10억 원 이상 여부
✅ 증빙 서류 준비: 계좌이체 내역, 주식양수도계약서, 주주명부
✅ 예정신고 기한: 반기 종료 후 2개월 이내 (8월 31일 또는 2월 28일)
✅ 필요경비 영수증: 수수료, 명의개서 비용 등
✅ 증권거래세 동시 신고: 양도가액의 0.43%
절세 전략 요약
- 분할 매도: 대주주 요건(10억 원)을 피하기 위해 여러 차례 나눠 매도
- 1년 이상 보유: 단기 매매 세율 33% 회피
- 필요경비 최대화: 거래 관련 모든 비용을 증빙
- 기본공제 활용: 연간 250만 원 공제 한도 활용
세무사 상담이 필요한 경우
- 양도가액이 1억 원 이상인 경우
- 여러 건의 거래가 복잡하게 얽혀 있는 경우
- 특수관계인 간 거래인 경우
- 환산취득가액을 적용해야 하는 경우
잘못된 신고로 인한 가산세와 추징금은 절세액보다 훨씬 클 수 있습니다. 전문가 상담 비용은 아끼지 마세요.
마치며: 세금은 미리 준비하는 것이 최선
비상장 주식 투자로 큰 수익을 올렸다면, 그만큼 세금 부담도 커집니다. 하지만 미리 준비하면 합법적인 절세가 가능하고, 가산세 폭탄도 피할 수 있습니다.
2026년 상반기 거래분은 8월 31일까지, 하반기 거래분은 2027년 2월 28일까지 예정신고를 완료하세요.
증빙 서류는 5년 이상 보관하고, 복잡한 거래는 반드시 세무사와 상담하시기 바랍니다.
이 글이 도움되셨다면 북마크하고 주변 투자자들과 공유해주세요!
다른글도 참고하세요
